Estudio de la estructura genética de poblaciones de vibrio cholerae



Autor:

farfan sellares m. isabel

Universidad:

barcelona

Departamento:

Informacion no disponible

Fecha de lectura:

11-10-2002

Director:


loren egea j. gaspar
TRIBUNAL

Presidente:

jofre torroella, joan

Secretario:

reque queralt, miguel

Vocal:

viñas ciordia, miguel

Vocal:

barcina lopez, isabel

Vocal:

lalucat jo, jordi


Descriptores:


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Resumen:


Se ha estudiado la variabilidad genética de poblaciones de V.cholerae procedentes de distintas fuentes y orígenes geográficos, que agrupan diferentes serogrupos y biotipos de esta especie. Se ha analizado la variabilidad genética a dos niveles: a un nivel proteico, aplicando la técnica de elctroforesis de aloenzimas multilocus (MLEE), y a un nivel génico, realizando el análisis de secuencias multilocus (MLST). Con ello, se ha intentando determinar la relación genética existente entre las distintas cepas estudiadas, considerando los datos obtenidos globalmente y por subrupos de poblaciones, para establcer la estructura poblacional y la diversidad génica que presenta V.cholerae. Un total de 107 cepas de V.cholerae, incluyendo 29 cepas pertenecientes al serogrupo 0139, fueron estudiadas aplicando la técnica de electroforesis de aloenzimas multilocus (MLEE) para determinar la variación alélica de 12 enzimas "housekeeping". Todos los loci fueron polimórficos y se identificaron 99 ETs para el total de la muestra. No se detectó una asociación significativa de las cepas en función de su serogrupo u origen geográfico. Se obtuvo el valor de diversidad génica media (H=0,50) más alto descrito para esta especie. El análisis del desequilibrio de ligamiento mostró una estructura clonal para el conjunto de la población, pero cuando se estudiaron subgrupos de esta población hubo excepciones, que hacen pensar en la existencia de un cierto grado de recombinación. Estos resultados sugieren que la población estudiada presenta una estructura poblacional epidémica. Para una colección de 29 cepas de serogrupo 0139 se ha realizado el análisis comparativo de fragmentos internos de 6 genes "housekeeping", aplicando la metodología de análisis de secuencias multilocus (MLST). Los resultados obtenidos muestran la existencia de al menos 3 clones distintos entre las cepas analizadas, contradiciendo la actual hipótesis monoclonal de est